74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2272 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  66.18 
 
 
68 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  61.19 
 
 
68 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  65.57 
 
 
68 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  56.52 
 
 
70 aa  84.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  57.35 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  54.41 
 
 
72 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  55.22 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  55.22 
 
 
74 aa  79.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  56.72 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  55.74 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  48.53 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  58.49 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  46.27 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  46.27 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  51.67 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  40.58 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  41.38 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  49.18 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  46.43 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  43.28 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  41.38 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  40.98 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  41.38 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  44.83 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  44.83 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.98 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  42.19 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  46.03 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.31 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  41.79 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  55.56 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  43.1 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  41.79 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  36.21 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  47.92 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  39.39 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  48.44 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  36.76 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  43.4 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  45.31 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  46.97 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  53.85 
 
 
56 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  38.24 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  32.2 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  32.2 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  32.2 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  43.33 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  39.62 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2967  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.436183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  38.24 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  42.11 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 
138 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  39.68 
 
 
71 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.17 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  31.67 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 
121 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>