35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0134 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2448  CopG domain protein DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 135 aa  165  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  36.43 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  35.38 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  32.23 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  30.65 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  28.8 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  28 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  28 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  34.71 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  27.2 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  32.14 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  30.43 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  31.67 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  31.62 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  39.68 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  35.94 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  31.52 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  28.79 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  27.78 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  30.71 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  27.42 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  29.63 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  26.02 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  27.91 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  31.3 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  31.3 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  31.3 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  38.36 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  25.6 
 
 		 131 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>