64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1959 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  270  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  51.16 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  38.17 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  38.93 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  38.93 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  38.93 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  38.17 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  35.38 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  34.88 
 
 		 139 aa  87.4  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  33.59 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  35.07 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  36.72 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  33.59 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  32.06 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  30.23 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  32.38 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  31.63 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  31.58 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  30.53 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  32.67 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  33.66 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  29.7 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  34.91 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  29.01 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  30.69 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  42.37 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  32.35 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  32.61 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  31.96 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  31.25 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  31.07 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  27.45 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  29.03 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  28.99 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1294  hypothetical protein  31.03 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.289412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  35.38 
 
 		 137 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  32.26 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  32.08 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  26.87 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  28.17 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  28.81 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  37.14 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  31.88 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  21.15 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  40.32 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  31.51 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  33.9 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  30.3 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>