38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1551 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  270  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  51.16 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  43.41 
 
 
138 aa  103  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  40.77 
 
 
124 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  41.09 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  39.69 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  35.66 
 
 
134 aa  92  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  37.21 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  36.43 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  36.43 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  36.43 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  36.15 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.59 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  37.8 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  30.23 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  33.59 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  32.56 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  32.09 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  36.17 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  39.44 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  31.58 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  31.93 
 
 
131 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  29.7 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 
212 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.69 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  31.19 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  29.46 
 
 
129 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  40.91 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  27.78 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  35.53 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0560  protein of unknown function UPF0150  30.59 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  30.83 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  26.15 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  35.59 
 
 
132 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  35.85 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  40.98 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  31.58 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>