47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5716 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  273  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6675  protein of unknown function UPF0150  46.81 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  37.32 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  35.25 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  35.04 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2611  hypothetical protein  35.51 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0233173  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  30.83 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  36.09 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  36.09 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  31.34 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  31.34 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  31.34 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.34 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  31.34 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1336  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2724  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1448  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2707  hypothetical protein  32.82 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  31.65 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  29.77 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  32.58 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  33.67 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  32.61 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  40.62 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  27.88 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  33.75 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  38.18 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  35.94 
 
 		 142 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  38.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 68 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  33.75 
 
 		 86 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 68 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  37.7 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  33.82 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  32.95 
 
 		 138 aa  40.8  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  38.33 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  34.55 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.58 
 
 		 147 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>