99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0452 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  71.7 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  56.72 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  52.24 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  60.66 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  52.94 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  49.25 
 
 		 68 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  46.27 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  49.25 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  53.33 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  40.58 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  55.93 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  45.16 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  46.27 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  47.62 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  41.38 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  42.42 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  46.27 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  48.21 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  42.86 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  47.69 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  41.94 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  44.44 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  42.37 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  40.62 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  39.71 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  42.25 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  52.83 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  43.1 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  42.67 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  41.07 
 
 		 69 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  46.3 
 
 		 72 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  45.76 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  38.57 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  36.92 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  47.92 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  38.57 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  38.57 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  35.94 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  32.31 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  35.38 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  41.38 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  33.85 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  30.77 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  30.77 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  52.78 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  42.59 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  40.48 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  38.24 
 
 		 130 aa  43.9  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  42 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  30.91 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2967  hypothetical protein  32.31 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.436183  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  38.98 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  35.19 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  31.43 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  30.43 
 
 		 68 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  34.72 
 
 		 72 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  30.43 
 
 		 68 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  28.57 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  37.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  36.76 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  34.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  28.81 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  35.94 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  34.29 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  45.45 
 
 		 48 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  42 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 71 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>