75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0078 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  46.97 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  37.21 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  87.4  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  34.88 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  35.61 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  26.19 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  32.8 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  35.51 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  45.59 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  28.91 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  28.91 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  30.95 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  28.35 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  34.26 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  26.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  26.56 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  24.41 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  27.34 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  29.25 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  31.86 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  31.13 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  26.83 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  32.84 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  28.19 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  39.22 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  24.03 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  41.94 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  28.97 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  31.58 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  27.91 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  33.67 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  38.6 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  36 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  38.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  29.31 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  36.36 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  28.3 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  32.86 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  28.8 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  34.62 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  32.81 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  36.54 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  29.41 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  38.64 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  32.03 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  27.74 
 
 		 136 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  27.74 
 
 		 134 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>