77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0585 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  63.24 
 
 
75 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  62.32 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  59.42 
 
 
80 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  59.42 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  50.75 
 
 
72 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  58.46 
 
 
68 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  61.29 
 
 
68 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  52.31 
 
 
68 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  56.72 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  52.24 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  61.82 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  55.93 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  59.26 
 
 
81 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  44.93 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  46.03 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  40.3 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  40.3 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  41.27 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  43.64 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.1 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  43.1 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  37.93 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  41.38 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  47.06 
 
 
56 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  40.35 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  45.45 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  39.66 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  41.82 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  38.6 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  42.31 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44.9 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  44.23 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  48.84 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  41.79 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40.98 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  45.1 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  36.07 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  36.54 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  36.67 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  33.33 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  41.51 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  35.82 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  35.85 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  35.85 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  35.85 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  41.51 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2967  hypothetical protein  35.85 
 
 
64 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.436183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
136 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  39.29 
 
 
84 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  38.98 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1106  hypothetical protein  63.64 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  40.62 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  39.13 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
121 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>