85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0515 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  156  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  69.57 
 
 
74 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  63.24 
 
 
69 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  61.76 
 
 
70 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  58.21 
 
 
72 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  58.82 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  60 
 
 
68 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  55.22 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  53.85 
 
 
68 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  58.06 
 
 
68 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  46.27 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  58.49 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  44.78 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  53.33 
 
 
71 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  49.18 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  49.15 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  46.97 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  47.54 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  45 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  41.38 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  51.92 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  35.82 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  35.38 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  41.67 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  39.34 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  38.57 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  40.68 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
74 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  48.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  44.62 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  37.04 
 
 
56 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  39.22 
 
 
145 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  36.62 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  37.7 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  38.98 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  36.54 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40.32 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  31.34 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  35.09 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  29.85 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  35.48 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1106  hypothetical protein  31.51 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  34.55 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  34.55 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  41.51 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  34.55 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 
74 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3662  protein of unknown function UPF0150  39.68 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 
74 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  40.38 
 
 
133 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  31.67 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  38.1 
 
 
73 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  30 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  28.57 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  30.65 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  39.29 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  40.74 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  39.22 
 
 
187 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  35.09 
 
 
72 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>