113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4921 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  140  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  55.93 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  53.33 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  52.46 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  53.33 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  52.46 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  46.88 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  51.67 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  45.31 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  51.67 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  45.9 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  40.98 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.07 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  43.75 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  50.98 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  45.45 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  43.75 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  42.62 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  43.1 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  41.54 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  42.19 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.93 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  54.17 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  40.98 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  45.83 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  32.81 
 
 
98 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  41.27 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  39.39 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  44.44 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  39.68 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  32.31 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  37.7 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  41.27 
 
 
72 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 
70 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  39.06 
 
 
135 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  47.92 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  38.98 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  45 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  40.62 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1787  hypothetical protein  46.15 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0271527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  36.23 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  38.57 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2967  hypothetical protein  46.15 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.436183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  42.19 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  31.48 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 
71 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  40.35 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  42.03 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  41.94 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  36.21 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  44 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  36.51 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  29.85 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3662  protein of unknown function UPF0150  33.82 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  37.93 
 
 
74 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  34.85 
 
 
73 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  37.7 
 
 
72 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  43.75 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35.48 
 
 
137 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  39.66 
 
 
70 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  46.34 
 
 
48 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  39.66 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>