52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0802 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  167  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  48.65 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  45.83 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  44.93 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  48.57 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  44.78 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  44.12 
 
 
72 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  40.58 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  46.88 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  45.9 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  40.58 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  46.3 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  40.35 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  45.83 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  46.81 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  34.78 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  43.1 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  40.74 
 
 
81 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  43.1 
 
 
136 aa  48.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  42.62 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  43.55 
 
 
79 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  43.55 
 
 
79 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  36.92 
 
 
134 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  41.82 
 
 
69 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  35.59 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  36.51 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.48 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  32.86 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  41.86 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  38.98 
 
 
128 aa  43.5  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  39.22 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  42  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  41.86 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  45.24 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  31.88 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  47.5 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35.48 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  40.38 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 
133 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  34.78 
 
 
74 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>