100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6579 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  56.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  44.62 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  42.22 
 
 
137 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  41.48 
 
 
137 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  42.54 
 
 
131 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  45.38 
 
 
142 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  40.29 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  39.85 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.15 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  41.46 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  39.34 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  47.62 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  42.86 
 
 
136 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  41.96 
 
 
136 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  37.59 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40.46 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.98 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  32.59 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  34.92 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  32.58 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  37.69 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  39.23 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  39.34 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  34.62 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  36.96 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  36.3 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  35.07 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  32.31 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  34.65 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  33.86 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  33.11 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  35.29 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  31.4 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  31.86 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  30.3 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  30.08 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  29.57 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  29.57 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  29.57 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  32.31 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  29.23 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  48.98 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  34.48 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  30.66 
 
 
131 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  28.43 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  44.68 
 
 
66 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  44.68 
 
 
66 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  27.27 
 
 
121 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  37.04 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  35.38 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  38.6 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  29.82 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  39.58 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  34.21 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  38.46 
 
 
71 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1128  peptidase M61 domain protein  27.55 
 
 
627 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144459  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  28.07 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1740  hypothetical protein  42.55 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0186698  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  41.18 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  39.66 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  41.51 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  29.49 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  29.03 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  34.55 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  34.69 
 
 
71 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  39.22 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 
67 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  40.43 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  35.29 
 
 
57 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  26.15 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  36.73 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  36.23 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  52.78 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  56.25 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  25.96 
 
 
139 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4442  glycyl aminopeptidase  36.54 
 
 
682 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>