113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2545 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 130 aa  253  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  59.23 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  54.69 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  47.2 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  40.31 
 
 		 136 aa  94  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  41.13 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  37.98 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  34.35 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40.8 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  39.68 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  39.23 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  35.16 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.98 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  37.6 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  35.66 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  35.38 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  35.66 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  36.43 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  29.6 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  35.43 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  50.79 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  35.07 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  33.86 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  29.69 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  32.06 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  28.46 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  31.53 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  35.64 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  30.33 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  29.01 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  30.17 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  32 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  42.19 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  27.34 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.05 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  37.31 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  30.09 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  43.14 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  30.19 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.8 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  30.22 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  27.34 
 
 		 147 aa  50.8  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  25.37 
 
 		 187 aa  50.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  32.5 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  28.44 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  36.23 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  37.88 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  40.96 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  41.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  31.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  31.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  29.71 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  31.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  29.35 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  29.89 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  35.48 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  38.33 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  37.88 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  40.35 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  23.31 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  29.89 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  29.31 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  39.68 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  41.86 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  34.43 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  41.51 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  29.31 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  28.8 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  33.9 
 
 		 70 aa  43.5  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  27.91 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  33.9 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  34.33 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>