118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5735 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
130 aa  273  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  49.54 
 
 
121 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  45.54 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  46.53 
 
 
122 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  45.61 
 
 
121 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  44.74 
 
 
121 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  43.65 
 
 
147 aa  100  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  45.37 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  41.44 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  43.33 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  38.94 
 
 
118 aa  87.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  37.4 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  37.21 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  34.15 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  52.54 
 
 
56 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  52.54 
 
 
56 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  48.28 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 
71 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  40.32 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  37.7 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  40.62 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  27.56 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  26.36 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  35.82 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 
70 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  40.98 
 
 
70 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  37.25 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 
69 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  25.83 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  35 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  26.47 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  30.3 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  36.67 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  38.89 
 
 
72 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  30.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  32.97 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  37.1 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  35.63 
 
 
115 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  29.49 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  29.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  29.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  26.47 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  30.77 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  29.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  29.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  29.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  48.89 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  34.43 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  24.56 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  39.29 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  34.43 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  37.25 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  31.65 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  37.04 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
70 aa  43.9  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  31.94 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  31.82 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  25.71 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  42.55 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  40.82 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  29.23 
 
 
134 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  40.82 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  38.3 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  32 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  31.48 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  32.2 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  32.2 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  31.48 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  42.86 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  35.42 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  31.48 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  33.82 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>