24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0947 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  233  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  63.06 
 
 
115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  50.44 
 
 
116 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0619  hypothetical protein  48.7 
 
 
117 aa  99  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  50.7 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2034  hypothetical protein  41.8 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000850419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  38.2 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  38.2 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  38.75 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  37.38 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  39.29 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  29.01 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  34.69 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  30.33 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  35.29 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  34.57 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  33.82 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  31.65 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  37.68 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  27.56 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  32.2 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  26.15 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  27.85 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>