121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1245 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  131  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  52.94 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  59.18 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  56.6 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  38.46 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  57.14 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  57.14 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  47.17 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  44.26 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  43.28 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  58.33 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  49.06 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  51.92 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  50.94 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  51.92 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  50.94 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  41.79 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  48.39 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  65.91 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  53.06 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  52.83 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  50.98 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  58.14 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  46.15 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  45.83 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  41.54 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  52.08 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  51.11 
 
 		 48 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  49.02 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  51.02 
 
 		 74 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  45.28 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  51.02 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  48.98 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  41.54 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  42.31 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  48.84 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  42.86 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  40.38 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  47.62 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  48.98 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  41.51 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  52.5 
 
 		 56 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  42.59 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  47.06 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  48.84 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  54.29 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  44.62 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  39.22 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  48.84 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  43.4 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  41.51 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  59.46 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  47.92 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  43.14 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  41.18 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  62.5 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  35.85 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  45.28 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  40.74 
 
 		 55 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  36.54 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  47.5 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  55.88 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  55.88 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  44.9 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  45.24 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  40.91 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  43.59 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  36.67 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>