69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0712 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  235  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  92.98 
 
 
57 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  54 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  56.41 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  48.89 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  48.89 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  55.81 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  38.03 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  48 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  48 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  48.84 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  54.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  48.89 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  55.81 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  48.84 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  44.19 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  44.68 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  48.84 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  47.62 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  42.22 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  41.18 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  36.14 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  45.45 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  44.19 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  31.65 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  47.5 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  33.8 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  29.49 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1787  hypothetical protein  32.31 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0271527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  42.5 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  44.19 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  51.52 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  43.18 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  44 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  41.86 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  51.52 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  34.09 
 
 
134 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  37.21 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.21 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  30.26 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  32.86 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  41.03 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  35.56 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  32.2 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  31.15 
 
 
76 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  27.5 
 
 
136 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  44.19 
 
 
68 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  44.19 
 
 
68 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  41.3 
 
 
131 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  44.44 
 
 
74 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>