28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1787 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1787  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  136  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0847  protein of unknown function UPF0150  66.18 
 
 		 68 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1440  hypothetical protein  67.24 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1526  protein of unknown function UPF0150  71.93 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0886  hypothetical protein  65.52 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1553  hypothetical protein  66.07 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0455  hypothetical protein  61.02 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4102  hypothetical protein  65.12 
 
 		 47 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  44.64 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  32.31 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  39.34 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 		 68 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 		 68 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  35.09 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  46.55 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  41.07 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  42 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>