43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1176 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  70 
 
 
72 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  59.65 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  57.89 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  67.35 
 
 
64 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  61.22 
 
 
69 aa  66.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  50.85 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  57.45 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.26 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  46.94 
 
 
72 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  44.68 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  38.71 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  40.82 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  41.07 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  43.75 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  43.64 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  41.86 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  48.72 
 
 
117 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  38.78 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  32.65 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  38.78 
 
 
74 aa  40.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  38.3 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  48.72 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  38.3 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  39.58 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  47.92 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  39.58 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  46.15 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>