42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0248 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  130  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  67.19 
 
 
76 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  64.15 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  62.5 
 
 
72 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  58.33 
 
 
72 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  64 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  67.35 
 
 
69 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  64.44 
 
 
73 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  45.45 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  39.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  46 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 
74 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  34.72 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  39.62 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  44.68 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  44.68 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  42 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1740  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0186698  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  47.17 
 
 
108 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  34.55 
 
 
79 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
69 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  34.55 
 
 
79 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  40.35 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  33.96 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  41.03 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  35.71 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  41.03 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  38.18 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  32 
 
 
135 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  34.69 
 
 
69 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>