71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0620 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  53.73 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  51.47 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  52.86 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  57.97 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  58.33 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  47.06 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  45.95 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  43.48 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  57.45 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  52.83 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  52.83 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  47.3 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  47.3 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  60.42 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  46.88 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  57.14 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  45.95 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  50.94 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  50.94 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  52.17 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  57.14 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  52.17 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  57.14 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  48.08 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  43.14 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  41.54 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  47.92 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  56.82 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  34.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  46.51 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  42.22 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  35.82 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  34.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  34.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  33.82 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  35.42 
 
 		 48 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  45.65 
 
 		 134 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  25.61 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  51.28 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  36.54 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  39.29 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  39.39 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  36 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  45.1 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  38.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>