48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1149 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  141  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  79.71 
 
 
69 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  62.32 
 
 
76 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  51.47 
 
 
72 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  56.52 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  64.15 
 
 
64 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  61.22 
 
 
69 aa  66.6  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  46.97 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  34.92 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  42.65 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  44.68 
 
 
71 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  35.71 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  39.39 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  47.83 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  38.57 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  41.3 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  46.81 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  44.19 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  43.75 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  46.15 
 
 
72 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  46.15 
 
 
72 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  38.64 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  34.04 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  34.04 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  36.76 
 
 
78 aa  43.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  35.56 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  36.17 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  39.22 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  42.03 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  36.17 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  42.22 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 
134 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  34.69 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  38.1 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  32.14 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  32.14 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  32.86 
 
 
72 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  32.86 
 
 
72 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  32.86 
 
 
72 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  32.86 
 
 
75 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>