20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1470 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  144  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  48.48 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  47.22 
 
 
73 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  38.89 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  41.43 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  44.29 
 
 
72 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  34.33 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  32.86 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  34.29 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0500  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  32.86 
 
 
69 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.6 
 
 
137 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>