49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0021 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  53.45 
 
 
74 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  53.45 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  53.45 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  40.85 
 
 
71 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  49.06 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  40.28 
 
 
72 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  41.67 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.64 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  47.92 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  35.48 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  47.06 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  41.51 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  31.67 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  44 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  56.82 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  45.28 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  48.89 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  48.28 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  48.89 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  40.32 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  37.88 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  37.88 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  44.68 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  42 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  42.22 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  43.48 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  44.19 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  47.83 
 
 
72 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 
67 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  38.3 
 
 
108 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 
67 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0358  hypothetical protein  42.86 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  40.35 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  45.1 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  35.85 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  35.94 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  40.48 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  36.17 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  40.48 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>