19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1441 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 69 aa  140  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  68.12 
 
 		 69 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  42.65 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  41.43 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  41.43 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  41.43 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  41.43 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  38.81 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  38.16 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  39.71 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0500  hypothetical protein  57.58 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  35.53 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  34.69 
 
 		 64 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>