38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1234 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 66 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  54.9 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  42.42 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  62.5 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  52.08 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  48.28 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  61.54 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  61.54 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  46.3 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  46.43 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  45.83 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  41.54 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  55.81 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  39.39 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  39.39 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  55.81 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  47.92 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  36.36 
 
 		 55 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  35.82 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  35.29 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  36.23 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  48.84 
 
 		 113 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 67 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>