34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1721 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  100 
 
 		 119 aa  243  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  72.41 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  45.74 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  47.62 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  48.28 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  43.18 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  42.05 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  40.23 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42.68 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  44.59 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  33.72 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  31.4 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  34.18 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  40.82 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  44.9 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  42 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  32.58 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  31.46 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  28.05 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  38.18 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  35.71 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>