49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0595 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
81 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  63.29 
 
 
86 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  55.7 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  48.15 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  55.32 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  47.17 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  48.08 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  45.1 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  44.23 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  44.23 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  43.14 
 
 
72 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  32.93 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  43.75 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  37.66 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  35.53 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  39.06 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  34.92 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  40.74 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  33.85 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  39.22 
 
 
145 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
68 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
68 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  39.22 
 
 
145 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  39.22 
 
 
145 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 
145 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 
145 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  39.22 
 
 
72 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.22 
 
 
145 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  39.22 
 
 
145 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  39.22 
 
 
72 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  39.22 
 
 
145 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  53.85 
 
 
48 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0379  protein of unknown function UPF0150  34.55 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201735  hitchhiker  0.00342106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  36.96 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  38.64 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  32.73 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  39.13 
 
 
57 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  40.48 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  32.73 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  31.48 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  31.48 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  39.34 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>