54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2221 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  99.31 
 
 		 145 aa  291  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  99.31 
 
 		 145 aa  291  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  99.31 
 
 		 145 aa  291  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  48.53 
 
 		 138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2707  hypothetical protein  52.9 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  34.97 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  35.2 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  37.19 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  31.34 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  36.89 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  35.94 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  35.94 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6675  protein of unknown function UPF0150  30.37 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1448  hypothetical protein  28.24 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2724  hypothetical protein  28.24 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1336  hypothetical protein  28.24 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  26.23 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  30.36 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  38.27 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2611  hypothetical protein  27.4 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0233173  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  27.07 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  34.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  34.85 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  29.27 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  34.57 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3400  hypothetical protein  25.76 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  27.03 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  31.08 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3554  hypothetical protein  52.63 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000322896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  41.51 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  32.35 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1294  hypothetical protein  48.84 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.289412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  41.82 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  34.33 
 
 		 137 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  34.85 
 
 		 137 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  39.22 
 
 		 81 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  33.87 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1114  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.463987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  36.73 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  32.81 
 
 		 142 aa  40.8  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3662  protein of unknown function UPF0150  24.83 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  29.31 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  37.21 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5990  hypothetical protein  29.1 
 
 		 144 aa  40  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  48.78 
 
 		 140 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>