37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1733 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  42.11 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  39.1 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  38.52 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  35.94 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  35.94 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  35.94 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  35.94 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.94 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  35.94 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  35.88 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1114  protein of unknown function UPF0150  52.78 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.463987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  34.88 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2707  hypothetical protein  34.85 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  28.68 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6675  protein of unknown function UPF0150  33.59 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2611  hypothetical protein  31.06 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0233173  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5990  hypothetical protein  32.86 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1448  hypothetical protein  29.63 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1336  hypothetical protein  29.63 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2724  hypothetical protein  29.63 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3400  hypothetical protein  27.07 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  28.85 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  31.58 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  37.78 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  37.78 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  23.89 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>