16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5990 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5990  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  0.130137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  29.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  29.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  29.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  29.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  29.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  29.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  32.86 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  32.86 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  38.1 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  29.06 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  33.73 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>