26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0305 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  293  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  43.07 
 
 		 231 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  34.97 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  34.97 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  34.97 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  35.51 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  37.32 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  34.27 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  34.27 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  34.27 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2611  hypothetical protein  34.29 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0233173  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6675  protein of unknown function UPF0150  34.04 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2707  hypothetical protein  36.76 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1448  hypothetical protein  33.08 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1336  hypothetical protein  33.08 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2724  hypothetical protein  33.08 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  31.69 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  28.37 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  28.38 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3400  hypothetical protein  33.05 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  34.88 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  34.88 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3662  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 146 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  27.41 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>