63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2707 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2707  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  54.41 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  52.9 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  52.9 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  52.9 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  52.9 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  52.9 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  52.9 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  52.9 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  36.76 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  36.43 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  32.82 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  36.59 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  35.77 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  34.09 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  34.09 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  31.39 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3400  hypothetical protein  27.94 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  30.83 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6675  protein of unknown function UPF0150  26.52 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2611  hypothetical protein  29.63 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0233173  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  32.56 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  30.43 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  30.28 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1448  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  27.43 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2724  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1336  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994026  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  31.5 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1114  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.463987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  32.43 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  27.74 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  32.58 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  26.96 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  40.62 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  38.36 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0560  protein of unknown function UPF0150  35.62 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  38.1 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  31.15 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  34.43 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  35.44 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  36.92 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  35 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  32.81 
 
 		 136 aa  42  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  31.94 
 
 		 72 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  45.24 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  30.19 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  32.26 
 
 		 98 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>