14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0560 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0560  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 154 aa  320  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2219  hypothetical protein  35.66 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.42673  normal  0.203877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2246  hypothetical protein  35.66 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.922989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  33.64 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0127  DNA binding domain protein, excisionase family  49.09 
 
 		 443 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  35.94 
 
 		 380 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 365 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00013023  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  30.59 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  35.94 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2899  DNA binding domain protein, excisionase family  38.33 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  35.23 
 
 		 152 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.45 
 
 		 368 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  37.88 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>