19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1114 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1114  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 78 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.463987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  52.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  52.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  42.65 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  41.67 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  38.81 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  42.37 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  36.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  35.62 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  30.14 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  40.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  40.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  40.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  40.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>