25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1029 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1733  hypothetical protein  35.11 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1423  protein of unknown function UPF0150  35.11 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  32.09 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  32.58 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  35.82 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  28.89 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1114  protein of unknown function UPF0150  42.65 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.463987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2611  hypothetical protein  25.53 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0233173  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  27.07 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  27.07 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  27.07 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.07 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  27.07 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3400  hypothetical protein  26.06 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  30 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1448  hypothetical protein  26.06 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  27.41 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  32.94 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2707  hypothetical protein  28.46 
 
 		 135 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>