18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3662 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3662  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
146 aa  291  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1498  hypothetical protein  34.48 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.743357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  29.93 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  39.39 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  33.82 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0305  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140045  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  39.68 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0346423 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  24.83 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  24.83 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  24.83 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0482  hypothetical protein  29.51 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000043148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  24.83 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  24.83 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  24.83 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  24.83 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.83 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>