32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4387 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 56 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 56 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  52.54 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  48.08 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  39.62 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  61.11 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  51.16 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  49.02 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  41.46 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  41.46 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  48.78 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  41.46 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  39.53 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  43.75 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  52.38 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  41.46 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  43.9 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 135 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  45.24 
 
 		 48 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  40.48 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  46.15 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>