44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4580 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  49.15 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  55.32 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  53.19 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  58.14 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  52.38 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  42.37 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  49.09 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  44.23 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  35 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  43.24 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  45.65 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.31 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  46.34 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  31.08 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  39.22 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  36.62 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  35 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  45.65 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  35 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  41.27 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  41.07 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  45.65 
 
 		 72 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  31.88 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  37.68 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  43.18 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  30.36 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>