37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0218 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  68.57 
 
 		 71 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  67.14 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  51.52 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  51.61 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  40.58 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  35.48 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  40.62 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  34.85 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  47.27 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  35.85 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  36.51 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  37.04 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  29.51 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  29.51 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  43.75 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  38.89 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  39.06 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  35.48 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  37.7 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>