79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4320 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  88.24 
 
 		 68 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  83.61 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  68.66 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  66.18 
 
 		 69 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  58.46 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  60 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  53.03 
 
 		 72 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  55.38 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  58.46 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  56.72 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  62.96 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  52.46 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  43.33 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  43.33 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  43.75 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  46.27 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  46.67 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  49.21 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  38.33 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  38.98 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  43.64 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  47.92 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  36.76 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 134 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  37.29 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  37.29 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  37.29 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  36.51 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  47.17 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  41.51 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  42.31 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  40.68 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.81 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  35.29 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  34.43 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  39.34 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  41.67 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  29.69 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  37.14 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  31.82 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2967  hypothetical protein  37.93 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.436183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  32.31 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  37.74 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  43.33 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  32.35 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  37.31 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  38.6 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  38.6 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4876  hypothetical protein  32.26 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  41.03 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  31.82 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  29.69 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  36.92 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  38.6 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.14 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>