21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1629 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  46.97 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  46.27 
 
 
68 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  46.27 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  40.3 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  44.62 
 
 
74 aa  57.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  46.27 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  43.28 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  41.54 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  45.83 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 
71 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 
71 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  33.85 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  35.71 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  48.94 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  38.57 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  39.39 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>