19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0592 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  52.94 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  47.17 
 
 
72 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  41.38 
 
 
70 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  55.56 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  44.83 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  45.1 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  44.9 
 
 
70 aa  48.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  37.68 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  41.38 
 
 
68 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  44.9 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  42.55 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  29.23 
 
 
135 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  29.23 
 
 
135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  48.94 
 
 
69 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  29.23 
 
 
135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  40.32 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>