32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2022 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  67.01 
 
 		 97 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  76.29 
 
 		 94 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  76.84 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3281  hypothetical protein  53.33 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  45.92 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  44.83 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  45.36 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  49.32 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  39.76 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  48.84 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  37.29 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  47.06 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  45.65 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  48.78 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  45.65 
 
 		 145 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  32.95 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  53.66 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.25 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  45.95 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  44.12 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 72 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>