37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1108 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1938  hypothetical protein  66.04 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  55.38 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  55.38 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  46 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  44.9 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  40.38 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 		 51 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  48.98 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  39.66 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  41.54 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  41.51 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0150  protein of unknown function UPF0150  38.64 
 
 		 132 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 79 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  29.69 
 
 		 74 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 79 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  39.29 
 
 		 69 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  43.75 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  28.77 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  41.3 
 
 		 55 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  45.83 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  35.42 
 
 		 75 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>