25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4318 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
51 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  87.23 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  70.21 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  65.12 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  71.43 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  58.14 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  59.09 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0852  hypothetical protein  57.5 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  52.27 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  46.51 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  44.23 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  53.66 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  46.34 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  54.35 
 
 
72 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  54.35 
 
 
72 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  48.84 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  48.94 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  44.9 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  48.84 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3222  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151978  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  44.19 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  34.04 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.078496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>