37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4380 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
75 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  66.67 
 
 
75 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  64.79 
 
 
73 aa  103  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  54.29 
 
 
73 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  55.71 
 
 
73 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  87.23 
 
 
51 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  72 
 
 
81 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
74 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
74 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  43.66 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  53.19 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  42.42 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0852  hypothetical protein  62.79 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  56.82 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  53.19 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  46.38 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  44.12 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  60.42 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  53.19 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  42 
 
 
88 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  42 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3222  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151978  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  60.42 
 
 
72 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  60.42 
 
 
72 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  51.02 
 
 
79 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  51.02 
 
 
79 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3012  hypothetical protein  45.1 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0572  hypothetical protein  48.98 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  43.06 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1938  hypothetical protein  52.27 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  46.15 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0904  hypothetical protein  39.13 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.706958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  32.47 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>