29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2716 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  65.75 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  69.86 
 
 
73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  69.01 
 
 
75 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  64.79 
 
 
75 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  65.12 
 
 
51 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  47.06 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  39.19 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  39.19 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  39.19 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  55.32 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  53.33 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  53.33 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  38.24 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0852  hypothetical protein  52.08 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  46.51 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  38.89 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  44.44 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3222  hypothetical protein  44.68 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151978  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  51.06 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3012  hypothetical protein  44.68 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  34.29 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  32.84 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  43.75 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>