21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0871 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  154  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  81.16 
 
 		 69 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  78.57 
 
 		 70 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  58.73 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  54.69 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  44.93 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4008  hypothetical protein  62.16 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  44.12 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  37.88 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  39.44 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  37.14 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  31.65 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0811  hypothetical protein  38.1 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00560796  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  32.84 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1229  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>