26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1097 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1097  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  68.57 
 
 
70 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  64.06 
 
 
69 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  61.54 
 
 
70 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  54.69 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  52.38 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2120  hypothetical protein  46.48 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129821  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0670  hypothetical protein  46.03 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.078496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5957  hypothetical protein  46.03 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0249  hypothetical protein  46.97 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  53.19 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4008  hypothetical protein  58.97 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1293  hypothetical protein  56.52 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.598885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1229  protein of unknown function UPF0150  53.73 
 
 
73 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2966  protein of unknown function UPF0150  52.17 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.402852  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2716  hypothetical protein  38.89 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287046  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  45.28 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1747  hypothetical protein  43.18 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19825  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3012  hypothetical protein  47.5 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4318  protein of unknown function UPF0150  44.19 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  47.27 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  47.27 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2236  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>